Wissenschaftler an der Universität von East Anglia sind Vorreiter einer neuen Art und Weise zu finden, die Bakterien und Viren im Zusammenhang mit Krebs.
Einige Infektionen wurden bereits in Verbindung mit Krebsarten wie Magenkrebs und Gebärmutterhalskrebs.
Neue Forschung veröffentlichte heute in der Genom-Biologie zeigt, wie genomische Daten, die aus den Tumoren konnte sequenziert werden, um zu offenbaren andere assoziierte Bakterien und Viren.
Es ist zu hoffen, dass die arbeiten helfen bei der Erkennung von Krebs-verursachenden Keime, und einen Tag sogar dazu führen, dass mehr Krebs-Impfstoffe wie die HPV-Impfstoff.
Lead-Forscher Dr. Dan Brewer, von UEA der Norwich Medical School und ein Besuch der Arbeiter am Earlham-Institut (EI), sagte: „Wir kennen bereits einige starke Assoziationen zwischen Infektionen und Krebs. Zum Beispiel das Vorhandensein von Helicobacter pylori im Magen-Darm-Trakt kann dazu führen, Magengeschwüre und ist im Zusammenhang mit Magen-Krebs.
„Mittlerweile sind einige Typen des HPV-virus Gebärmutterhalskrebs auslösen können.
„Menschliches Gewebe wird zunehmend ganze Genom sequenziert, wie wir den übergang in eine ära der Genom-Medizin.
„Wenn die Tumor-Proben sind ganze Genom sequenziert DNA aus beliebigen pathogens anwesend wird auch sequenziert werden, wodurch es möglich ist, zu erkennen und Quantifizierung von Krankheitserregern.
„Das gibt uns eine fantastische Möglichkeit, um Daten zu sammeln, die uns helfen, neue Assoziationen zwischen Bakterien und Viren und verschiedene Arten von Krebs.“
Das research-team produziert computer-Simulationen zu testen, gibt es verschiedene Ansätze vor dem ausführen von tests auf realen Krebs-Sequenz-Daten, wo eine Reihe interessanter Krankheitserreger erkannt wurden.
Doktorand Abraham Gihawi, auch von UEA der Norwich Medical School, sagte: „Es gibt bereits eine fülle von wissenschaftlichen tools zum klassifizieren der Organismen, von Ihrer Genom-Sequenz-Daten. Diese neue Forschung sieht in jedem der wichtigsten rechnerischen Schritte, die bei der Durchführung dieses auf die menschliche Gewebe-Sequenzierungs-Daten.
„Wir sammelten computer-Skripte, – Stich zusammen, um die leistungsfähigsten Werkzeuge zu übernehmen, um große Sammlungen von Sequenzierungs-Daten.
„Wir Computersimulationen und dann getestet, unsere Ansätze, einige echte Krebs-Sequenz-Daten.
„Für die Simulationen, die wir produziert ‚mock‘ Genome, die hauptsächlich menschliche Sequenzen und Spike Sie mit sehr kleinen zahlen von pathogenen Sequenzen, die ist, was wir erwarten, um zu sehen, in der Krebs-Sequenzen.
„Da wussten wir genau, was Krankheitserreger, und wie viel davon, sind in jeder simulierte Genom, wir konnten testen, wie gut jeder Ansatz führt.
„Wir haben dann getestet, unsere Methode auf einige echte Krebs-sequencing-Daten, wo wir wissen, was wir erwarten zu sehen.
„Sowie der Suche nach Erregern, die bekannt sind, um im Zusammenhang mit Krebs, wir auch erkannt und viele mehr. Wir sind gerade erst an der Oberfläche gekratzt auf die Rolle, die diese anderen Erreger spielen bei der Entstehung von Krebs.“