Über 1.000 Sequenzen des coronavirus-Genoms wurden nun produziert als Teil der Arbeit der Wissenschaftler und Mediziner von der University of Sheffield und der Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust.
Die Daten ist ein wichtiger Meilenstein für Ihre Arbeit als ein Teil von einem britischen Konsortium zu zuordnen, wie COVID-19 ausbreitet, verhält sich und mutiert. Es wird veröffentlicht werden in vollem Umfang auf einer öffentlichen Datenbank, die von den Forschern verwendet, und Wissenschaftler arbeiten an Lösungen, um die Corona-Virus-Ausbruch weltweit.
Unterstützt von der britischen Regierung, die £20 Millionen-Investition erlaubt Experten-Gruppen in ganz Großbritannien zusammen zu arbeiten, um schnell zu analysieren, die den genetischen code von Corona-Virus-Proben, die in der UK. Die Arbeit ist die Schaffung von Intelligenz zu teilen, die für die öffentliche Gesundheit Agenturen, Krankenhäuser, regionale NHS-Zentren und der Regierung zur Bekämpfung des virus.
Durch die Abbildung der COVID-19 genome, können die Wissenschaftler beobachten Veränderungen in der virus auf nationaler und globaler Ebene, Förderung von Verständnis, wie Sie es ausbreitet und mutiert zu informieren klinische Behandlung der Patienten und sogar Leben retten.
Die COVID-19 Genomik-britischen Konsortium umfasst die NHS, öffentliche Gesundheit Agenturen, Wellcome Sanger Institute, und zahlreiche wissenschaftliche Institutionen, darunter die University of Sheffield.
Dr. Thushan de Silva, Senior Clinical Lecturer und Honorary Consultant Physician bei Infektionskrankheiten von der University of Sheffield, führt der kollaborative Sheffield COVID-19 Genomik-Gruppe. Zu den Mitgliedern zählen Spezialisten aus der Universität Florey Institut für Wirt-Pathogen-Interaktionen, Sheffield Institut für Translational Neuroscience (SITraN), Abteilung für Tier-und Pflanzenwissenschaften, Abteilung für Molekularbiologie und Biotechnologie und die Fakultät für informatik.
Dr. Matthew Parker und Dr. Dennis Wang wurden die führenden Bioinformatik-Analyse für das Projekt, das Nationale Institut der Gesundheits-Forschung (NIHR) Sheffield Biomedizinischen Forschungszentrum und dem Fachbereich informatik.
Dr. Parker sagte: „Mit know-how in der Sheffield Bioinformatik-Core zu können, haben wir eine robuste pipeline, welche die genomischen Daten vor Virus-Fälle in unserer region und vergleicht Sie mit denen aus rund um die Welt, um neue Mutationen. Durch die Zusammenarbeit mit unseren nationalen und internationalen Partnern, werden wir in der Lage zu verfolgen, die Ausbreitung des virus und die Einrichtungen und das know-how haben wir hier in Sheffield sind der Schlüssel zu einem erfolgreichen Projekt wie dieses.
„Unsere Zusammenarbeit team, hat sich schnell erweitert seine Kapazitäten und formuliert neue Prozesse in der Lage sein, um die Sequenz von genomen auf einer Skala, die wir vorher nicht getan haben. Die Mitarbeiter im Labor sind jetzt Sequenzierung der Genome von Proben von Patienten mit bestätigten Fällen von COVID-19 mit einer rate von über 100 in der Woche.“
Dr. de Silva sagte: „mit Blick auf das gesamte virus-Genom im Menschen, die bestätigte Fälle des coronavirus, können wir beobachten Veränderungen in der virus auf nationaler und globaler Ebene zu verstehen, wie es sich ausbreitet.
„Die Arbeit ist die Unterstützung zu koordinieren agile Reaktionen auf neue Infektionskrankheiten wie Sie sich ausbreiten und mutieren in der lokalen Bevölkerung. Dies ist entscheidend für die Gesundheit Forschungs-community dazu beitragen kann, unser Verständnis der Ausbrüche von neuen Infektionskrankheiten, Information klinische Versorgung von Patienten und sogar Leben zu retten.“
Das team arbeitet in Partnerschaft mit Berater Virologen Dr. Cariad Evans, Dr. Mohammad Raza, Dr. Alison Bewältigen und Facharzt für Mikrobiologie Dr. Dave Partridge, der von der Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust regionalen NHS-Virologie-Laboratorium an der Northern General Hospital; reagieren auf den sich schnell entwickelnden Ausbruch des virus in der Yorkshire-region.