Mapping genetischen Varianten fahren Toxizität Leukämie-Therapie

Wissenschaftler am St. Jude Children ‚ s Research Hospital, neben Mitarbeitern rund um die Welt haben ein umfassendes Nachschlagewerk der funktionellen Varianten in einer wichtigen Droge-metabolisierenden Enzym namens NUDT15. Dieses umfassende Verständnis von NUDT15 Varianten bietet eine unschätzbare Ressource für die Vorhersage, welche Patienten behandelt mit thiopurine Medikamenten für akute lymphatische Leukämie (ALL) sind wahrscheinlich zu erleben Toxizität. Die Arbeit war heute veröffentlicht in den Verfahren der National Academy of Science.

Thiopurines wichtig sind antimetabolite Medikamente, die ein wichtiger Bestandteil der heilenden Behandlung für ALLE. Genetische Variationen können direkt Einfluss Drogen Toxizität und Wirksamkeit von thiopurines. Forscher am St. Jude und anderswo zuvor identifizierten NUDT15 Varianten, wie eine große genetische Ursache der Toxizität während der thiopurine Therapie, vor allem bei Menschen asiatischer und hispanischer Abstammung.

Die Pharmakogenetik ist eine Wissenschaft, die genomischen Daten verwendet, um Anleitung Präzision Medizin. Zur Umsetzung der genetischen-geführte Behandlung, die Forscher müssen eine strenge und Gründliche Kenntnisse über alle Varianten und deren Funktionen. Die überwiegende Mehrheit der genetischen Varianten im menschlichen Genom bleiben uncharacterized. Diese Varianten sind von unbekannter Bedeutung, so dass eine Lücke in unserem wissen darüber, wie zu implementieren Präzision-Medizin, einschließlich der Pharmakogenetik für diese Patienten.

„Um dieses Problem zu beheben, haben wir einen hohen Durchsatz für die experimentelle Charakterisierung der funktionellen Konsequenzen von 91% aller möglichen genetischen Varianten des NUDT15 gen,“ sagte senior-Autor Jun J. Yang, Ph. D., von der St. Jude-Abteilungen der Pharmazeutischen Wissenschaften und der Onkologie. „In der Spanne von nur ein paar Monaten, wir experimentell untersucht knapp 3.000 Varianten in diesem gen, die parallel und festgestellt, dass 30% Schaden, die wir vorhergesagt Ursache thiopurine Toxizität im Patienten.“

Varianten auf diese Weise identifizierten (durch Funktion) genauer vorherzusagen Toxizität bei Patienten, die mit thiopurines über bioinformatische algorithmen zu können. Verwendung von Patientendaten mit einer Untergruppe dieser Varianten, die Forscher fanden heraus, dass NUDT15 Varianten vorhergesagt durch diese Methode, um die Toxizität verursachen, haben induzieren solche Toxizität. Umgekehrt werden die Varianten vorhergesagt zu haben gutartige Auswirkungen nicht die Ursache der Toxizität. Während die Autoren warnen, dass künftige Studien mit größeren Fallzahlen sind erforderlich, um die Validierung dieser Ergebnisse, der ersten Ergebnisse vielversprechend.